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来自 : 发布时间:2024-05-03
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OligoSpec™ 计算器为您的寡核苷酸设计提供物理属性。快速计算寡核苷酸的分子量和消光系数。

重要提示 OligoSpec 计算器可输出特定寡核苷酸设计的物理特性。消光系数计算 - 消光系数通过以下方法计算:ε260 = [(所有碱基的 ε260 总和*) + (所有修饰的 ε260*)] x 0.9,以调整增色性。其中:碱基的 ε260 = dA (ε260=15,200)、dC(ε260=7,050)、dG(ε260=12,010) 和 T(ε260=8400)。所有 ε260 值均以 M-1•cm-1 为单位*所有消光系数值其他碱基和修饰可在 BiosearchTech.com 上每个寡核苷酸修饰的\"技术规格”选项卡下找到,或下载此 PDF。分子重量校准计算 - 主链分子量 (g/mol) 使用以下公式计算: MW(主链) = Σ(nbase * MWbase) + MW 修饰 + (nPO2 * MWPO2) + MWHAdj 其中:MWbase = 去质子化核苷的分子量。MWMod = 每个单独修饰的去质子化形式的分子量 nPO2 = 内部磷酸盐总数,即 nbases + nmods - 1.MWPO2 = PO2 的分子量,即 62.97。这是尚未包含在 MWbase 或 MWmod 中的磷酸键部分的 MW。MWHAdj = 0、1 或 2 个质子(即 0、1.01 或 2.02),具体取决于 3\' 和 5 的存在和结构\' 修饰。抗衡离子的添加​​只是分子量主链加上抗衡离子的总重量。该增加的重量通常等于寡聚物中磷酸根的数量乘以抗衡离子的重量。对于三乙铵 (TEA),每个抗衡离子的重量通常假定为 102.2。注意一些修改在分子量计算中添加额外的磷酸基团,例如 3\' 磷酸修饰或 3\' 胸苷连接修饰。质子化分子量通常也等于主链重量加上磷酸总数乘以每个质子的 1.01( H+)。这是通常通过在负离子模式下运行的电喷雾质谱法观察到的分子量。主页支持工具Oligo 工具箱Oligo 工具箱使用我们的寡核苷酸工具箱快速执行常见的稀释和重悬计算,或使用新的 OligoSpec™ 计算器确定寡核苷酸的物理属性。OligoSpec 计算器

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通过重悬计算器消除溶解寡核苷酸时的猜测,轻松创建储备溶液。

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使用寡核苷酸稀释计算器确定寡核苷酸溶液的稀释度并为寡核苷酸创建等分试样工作库存。

了解更多寡核苷酸浓度计算器

使用分光光度计的吸收测量和消光系数可快速确定溶液中寡核苷酸的浓度。

了解更多主页支持工具工具免费轻松访问在线设计工具。此外,还可以使用我们的交互式光谱叠加工具检查哪些染料最适合您的机器。试剂节省计算器

了解更多Intellics 软件

Intellics 软件提供用于样品和测定信息、方案设计和荧光数据管理的界面和数据库和报告。

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使用我们的寡核苷酸工具箱快速执行常见稀释和重悬计算,或使用新的 OligoSpec™ 计算器确定寡核苷酸的物理特性。

了解更多光谱叠加工具

可视化常见荧光染料和猝灭剂的吸收和发射光谱。根据每个 qPCR 设备的推荐组合将它们叠加为多重组。

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免费在线设计软件可用于 qPCR 探针和引物、Stellaris™ RNA FISH 探针和 ChIRP 寡核苷酸。

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发布于 : 2024-05-03 阅读()